நிலையான அமினோ அமிலங்கள்
நிலையான (அல்லது பொதுவான) அமினோ அமிலங்களை வகைப்படுத்த மிகவும் பயனுள்ள பழக்கவழக்கங்களில் ஒன்று ஆர் குழுவின் (எ.கா., பக்கச் சங்கிலி) துருவமுனைப்பை (அதாவது மின்சார கட்டண விநியோகம்) அடிப்படையாகக் கொண்டது.
குழு I: அல்லாத துருவ அமினோ அமிலங்கள்
குழு I அமினோ அமிலங்கள் கிளைசின், அலனைன், வாலின், லுசின், ஐசோலூசின், புரோலின், ஃபெனைலாலனைன், மெத்தியோனைன் மற்றும் டிரிப்டோபான். இந்த அமினோ அமிலங்களின் ஆர் குழுக்கள் அலிபாடிக் அல்லது நறுமணக் குழுக்களைக் கொண்டுள்ளன. இது அவர்களை ஹைட்ரோபோபிக் (“நீர் பயம்”) ஆக்குகிறது. அக்வஸ் கரைசல்களில், குளோபுலர் புரதங்கள் முப்பரிமாண வடிவத்தில் மடிந்து இந்த ஹைட்ரோபோபிக் பக்க சங்கிலிகளை புரத உட்புறத்தில் புதைக்கும். குழு I அமினோ அமிலங்களின் வேதியியல் கட்டமைப்புகள்:
ஐசோலூசின் என்பது லுசினின் ஐசோமராகும், மேலும் இதில் இரண்டு சிரல் கார்பன் அணுக்கள் உள்ளன. நிலையான அமினோ அமிலங்களில் புரோலின் தனித்துவமானது, அதில் இலவச α- அமினோ மற்றும் இலவச α- கார்பாக்சைல் குழுக்கள் இரண்டும் இல்லை. அதற்கு பதிலாக, புரோலின் நைட்ரஜன் அணு இரண்டு கார்பன் அணுக்களுடன் இணைக்கப்பட்டுள்ளதால் அதன் பக்கச் சங்கிலி ஒரு சுழற்சி அமைப்பை உருவாக்குகிறது. (கண்டிப்பாகச் சொன்னால், புரோலின் ஒரு அமினோ அமிலம் அல்ல, மாறாக α- இமினோ அமிலம் என்று பொருள்.) ஃபெனைலாலனைன், பெயர் குறிப்பிடுவதுபோல், அலனைனுடன் இணைக்கப்பட்ட ஒரு பினாயில் குழுவைக் கொண்டுள்ளது. கந்தக அணுவைக் கொண்ட இரண்டு அமினோ அமிலங்களில் மெத்தியோனைன் ஒன்றாகும். புரத உயிரியக்கவியல் (மொழிபெயர்ப்பு) இல் மெத்தியோனைன் முக்கிய பங்கு வகிக்கிறது, ஏனெனில் இது எப்போதும் தொடங்கும் அமினோ அமிலமாகும். மெத்தியோனைன் வளர்சிதை மாற்றத்திற்கான மீதில் குழுக்களையும் வழங்குகிறது. டிரிப்டோபனில் அலனைல் பக்க சங்கிலியுடன் இணைக்கப்பட்ட இந்தோல் வளையம் உள்ளது.
குழு II: துருவ, சார்ஜ் செய்யப்படாத அமினோ அமிலங்கள்
குழு II அமினோ அமிலங்கள் செரின், சிஸ்டைன், த்ரோயோனைன், டைரோசின், அஸ்பாராகின் மற்றும் குளுட்டமைன் ஆகும். இந்த குழுவில் உள்ள பக்க சங்கிலிகள் செயல்பாட்டுக் குழுக்களின் நிறமாலையைக் கொண்டுள்ளன. இருப்பினும், பெரும்பாலானவை நீர் மற்றும் பிற மூலக்கூறுகளுடன் ஹைட்ரஜன் பிணைப்புக்கு எலக்ட்ரான் ஜோடிகளுடன் குறைந்தபட்சம் ஒரு அணுவை (நைட்ரஜன், ஆக்ஸிஜன் அல்லது கந்தகம்) கொண்டிருக்கின்றன. குழு II அமினோ அமிலங்களின் வேதியியல் கட்டமைப்புகள்:
செரீன் மற்றும் த்ரோயோனைன் ஆகிய இரண்டு அமினோ அமிலங்கள் அலிபாடிக் ஹைட்ராக்சைல் குழுக்களைக் கொண்டுள்ளன (அதாவது, ஒரு ஹைட்ரஜன் அணுவுடன் பிணைக்கப்பட்ட ஆக்ஸிஜன் அணு, ―OH என குறிப்பிடப்படுகிறது). நறுமண வளையத்தில் டைரோசின் ஒரு ஹைட்ராக்சைல் குழுவைக் கொண்டுள்ளது, இது ஒரு பினோல் வழித்தோன்றலாகிறது. இந்த மூன்று அமினோ அமிலங்களில் உள்ள ஹைட்ராக்சைல் குழுக்கள் ஒரு முக்கியமான வகை பிந்தைய மொழிபெயர்ப்பு மாற்றத்திற்கு உட்பட்டவை: பாஸ்போரிலேஷன் (தரமற்ற அமினோ அமிலங்களுக்கு கீழே காண்க). மெத்தியோனைனைப் போலவே, சிஸ்டைனிலும் ஒரு கந்தக அணு உள்ளது. இருப்பினும், மெத்தியோனைனின் சல்பர் அணுவைப் போலன்றி, சிஸ்டீனின் கந்தகம் மிகவும் வேதியியல் ரீதியாக வினைபுரியும் (சிஸ்டைன் ஆக்சிஜனேற்றத்திற்கு கீழே காண்க). அஸ்பாரகின், முதலில் அஸ்பாரகஸிலிருந்து தனிமைப்படுத்தப்பட்டது, மற்றும் குளுட்டமைன் இரண்டிலும் அமைட் ஆர் குழுக்கள் உள்ளன. கார்போனைல் குழு ஒரு ஹைட்ரஜன் பிணைப்பு ஏற்பியாக செயல்பட முடியும், மேலும் அமினோ குழு (NH 2) ஒரு ஹைட்ரஜன் பத்திர நன்கொடையாளராக செயல்பட முடியும்.
குழு III: அமில அமினோ அமிலங்கள்
இந்த குழுவில் உள்ள இரண்டு அமினோ அமிலங்கள் அஸ்பார்டிக் அமிலம் மற்றும் குளுட்டமிக் அமிலம். ஒவ்வொன்றும் அதன் பக்கச் சங்கிலியில் ஒரு கார்பாக்சிலிக் அமிலத்தைக் கொண்டுள்ளன, அது அமில (புரோட்டான்-நன்கொடை) பண்புகளை அளிக்கிறது. உடலியல் pH இல் உள்ள நீர்வாழ் கரைசலில், இந்த அமினோ அமிலங்களில் உள்ள மூன்று செயல்பாட்டுக் குழுக்களும் அயனியாக்கம் செய்யப்படும், இதனால் ஒட்டுமொத்தமாக charge1 கட்டணம் வசூலிக்கப்படுகிறது. அயனி வடிவங்களில், அமினோ அமிலங்கள் அஸ்பார்டேட் மற்றும் குளுட்டமேட் என்று அழைக்கப்படுகின்றன. குழு III அமினோ அமிலங்களின் வேதியியல் கட்டமைப்புகள்
அஸ்பார்டேட் மற்றும் குளுட்டமேட்டின் பக்கச் சங்கிலிகள் அயனி பிணைப்புகளை (“உப்பு பாலங்கள்”) உருவாக்கலாம், மேலும் அவை ஹைட்ரஜன் பிணைப்பு ஏற்பிகளாகவும் செயல்படலாம். கட்டமைப்பு அல்லது செயல்பாட்டு நோக்கங்களுக்காக உலோக அயனிகளை (“மெட்டாலோபுரோட்டின்கள்”) பிணைக்கும் பல புரதங்கள் அஸ்பார்டேட் அல்லது குளுட்டமேட் பக்க சங்கிலிகள் அல்லது இரண்டையும் கொண்ட உலோக-பிணைப்பு தளங்களைக் கொண்டுள்ளன. இலவச குளுட்டமேட் மற்றும் குளுட்டமைன் அமினோ அமில வளர்சிதை மாற்றத்தில் முக்கிய பங்கு வகிக்கின்றன. குளுட்டமேட் என்பது மத்திய நரம்பு மண்டலத்தில் அதிக அளவில் உற்சாகமூட்டும் நரம்பியக்கடத்தி ஆகும்.
